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Para entender el #CoronaVirus en China: @ZulmaCucunuba

Como muchos, estoy fascinada 🤩 y algo preocupada 😦 por lo que la ciencia abierta en solo 17 días nos ha permitido entender acerca de un nuevo virus con potenciales implicaciones mundiales.


#coronavirus #2019nCov

Como es un tema relevante para todos, les voy a contar detalles:
El 31 de diciembre 2019 fue identificado un virus nuevo #2019nCov como causante de infección respiratoria en 41 personas en ciudad de Wuhan, China

Estos casos habían visitado en días previos un mercado específico en Wuhan. Dado esto, el mercado fue cerrado el 1 enero 2020.

Durante la primera semana de enero no se presentaron nuevas infecciones, llevando a concluir inicialmente que la fuente del virus era algo (desconocido) localizado en el mercado.

Y que era poco probable la transmisión humano-humano, la determinante de potencial expansión.

Muy importante, el gobierno chino e investigadores locales lograron secuenciar el virus #2019nCov en tiempo record.

Y más importante aún, el 11 enero 2020 liberaron las secuencias genéticas del virus al público para que cualquier persona las puediera analizar.

World Health Organization (WHO)

✔@WHO

BREAKING: WHO has received the genetic sequences for the novel (2019-nCoV) from the Chinese authorities. We expect them to be made publicly available as soon as possible.

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Esto permitió que a 12 de enero 2020 (en 1 día) investigadores en otras partes del mundo ya tuvieran análisis filogenéticos concluyentes.

Se logró establecer que #2019nCov es genéticamente similar a otros dos coronavirus ya conocidos pero diferentes #SARS y #MERS.
Trevor Bedford@trvrb

Thanks to rapid and open data sharing by China CDC, Wuhan Institute of Virology, Institute of Pathogen Biology and Fudan University, we know genomes from 6 of the novel coronaviruses isolated in Wuhan. I’ve posted a tree of these viruses here: https://nextstrain.org/groups/blab/sars-like-cov … 1/4

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Saber que #2019nCov es similar a otros dos coronavirus ya conocidos es importante para dimensionar potenciales implicaciones:

#SARS 2003: trans. H-H afectó 26 países, 8000 casos, mortalidad ~10%

#MERS 2012: trans. animal 🐫 humano mort ~ 35%. El 80% de casos en Arabia Saudita.
Tener las secuencias genéticas también permitió rápidamente desarrollar las pruebas diagnósticas para detectar #2019vCov y así empezar barridos de personas sintomáticas en aeropuertos internacionales de Asia con vuelos provenientes de Wuhan, China.
Así, a 12 de enero 2020 se detectó el primer caso de #2019nCoV fuera de China. Se trataba de una persona que viajó desde Wuhan a Tailandia.

IMPORTANTE esta persona no había visitado el mercado implicado inicialmente. Esto sugiere una fuente de transmisión humano-humano🚨
ProMED-mail

✔@ProMED_mail

PRO/AH/EDR> Novel coronavirus (04): China (HU), Thailand ex China, WHO https://zpr.io/tmc3j 

See ProMED-mail’s other Tweets

Simultáneamente, otro grupo de investigadores rápidamente analizaron las frecuencias de tráfico aereo internacional desde Wuhan y estimaron potencial riesgo de transmisión en Asia.

El 14 de enero 2020 publicaron su paper, bajo un esquema de revisión de pares <2 días.

Isaac Bogoch@BogochIsaac

Risk of novel coronavirus transmission via commercial air travel at the Journal of Travel Medicine.

Large Asian cities have greatest probability of importation.https://tinyurl.com/v5dvfsj 

Pneumonia of Unknown Etiology in Wuhan, China: Potential for International Spread Via Commercial…

Highlight. There is currently an outbreak of a pneumonia of unknown etiology in Wuhan, China. While there are still several unanswered questions, we evaluate t

academic.oup.com

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El 16 de enero, se reportó un caso nuevo en Japon, de un viajero desde Wuhan que tampoco había visitado el mercado.

Esto implicaba que entonces que la posibilidad de que hayan ocurrido casos sin detección es alta y que no es posible descartar la infección humano-humano.

La pregunta siguiente era:
– Es posible que la epidemia sea más grande que lo que se ha reportado?

Para responderla, otro grupo de investigadores, mis amigos y colegas 🥰del @MRC_Outbreak, reunieron la información pública y contruyeron un modelo para analizar rápidamente.
MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis@MRC_Outbreak

Size of Wuhan outbreak of a novel estimated from the three cases detected outside China: Likely to be over 1000 cases. @imperialcollege @mrc_outbreaks report released today

https://www.imperial.ac.uk/mrc-global-infectious-disease-analysis/news–wuhan-coronavirus/ …

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Qué analizaron?

– Retraso entre infección y reporte: usando fechas de síntomas, hospitalización y asumiendo periodo de incubación similar a MERS y SARS.

– Probabilidad de que un caso sea detectado fuera de Wuhan. Usando estimaciones demográficas y de tráfico aéreo diario.

El modelo es relativamente sencillo pero poderoso, permite estimar rápidamente el número de casos que han requerido hospitalización hasta el 12 de enero de 2020 en Wuhan.

Es decir, permite saber si es posible que en los hospitales ya hayan casos que han pasado desapercibidos.
Qué encuentran?
La probabilidad de que 1 persona viaje fuera de Wuhan antes de buscar cuidado médico es de 1/564. Dado que hay 3 casos detectados fuera de Wuhan eso implica q deben haber ~ 1700 casos (3×574) en Wuhan.

PERO con alta incertidumbre, intervalo confianza 190-4000+

Qué implicaciones tienen estos resultados?

1. Hay + casos que los reportados y deben examinar TODOS los pacientes de neumonía en hospitales de Wuhan y otras ciudades.

2. Hay que intensificar búsqueda en aeropuertos nacionales e internacionales con alta interconexión con Wuhan.

3. Aún hay muchos aspectos desconocidos y hay que seguir investigando hasta entender:

– Origen del virus. Muy posible, al igual que otros #coronavirus debe ser un animal, pero cuál?

– Transmisión humano-humano. Aún hay incertidumbre de si esto ocurre o no de forma sostenida.

Como ya dije, todo esto ha sido posible gracias a la ciencia abierta. Es decir, la producción de conocimiento científico con publicación inmediata de datos, métodos y resultados.

No ha habido revision x pares en la forma tradicional (2 pares anónimos), sino que los pares hemos

hemos sido el resto de la comunidad científica haciendo el escritinio, revisando rápidamente la metodología en tiempo real y hay que decirlo, en twitter.

Es un fenómeno sin precedentes y en mi opinión, representa la posibilidad de que juntos podamos controlar las epidemias.

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